Der 1983 in Bad Tölz geborene Balthasar Baumgartner war Jungstudent an der Universität „Mozarteum“ in Salzburg und studierte anschließend bis 2009 katholische Kirchenmusik und Orgel an der Hochschule für Musik und Theater München (Orgel bei Harald Feller, Improvisation bei Wolfgang Hörlin, Dirigieren bei Michael Gläser und Christoph Adt). Schon während seines Studiums war er als Organist und Kirchenmusiker tätig. 2008 gewann Baumgartner ein Stipendium des Deutschen Musikwettbewerbs in Bonn,wurde Preisträger des August-Everding-Musikwettbewerbs im Fach Orgel in München und Gewinner des Internationalen Mainzer Orgelwettbewerbs 2010 . Seit August 2009 ist Balthasar Baumgartner als musikalischer Assistent von Domkantor Oliver Sperling für den Mädchenchor am Kölner Dom in Stimmbildung und Chorarbeit tätig. Balthasar Baumgarthner ist  Stipendiat des Vereins „YEHUDI MENUHIN-Live Music Now“.